Denne institusjonen er dedikert til biologisk mangfold som et viktig trekk ved livet på jorden. Rikheten i Panamas natur gjør dette landet til et ideelt sted for et slikt museum.
Designet av Frank Gehry, vil komplekset være plassert midt i en stor park, og fremheve mangfoldet av flora og fauna i Mellom-Amerika. Den vil bli tegnet av landskapsarkitekten Edwina von Gal.
Paviljongene til museet vil inneholde en rekke utstillinger som vil tillate den besøkende å komme nærmere naturen, både bokstavelig og billedlig. Bruce Mau er ansvarlig for utformingen av utstillingen.
Bygningene vil bli dekket med flerfargede tak som vil være synlige på lang avstand - regner med de turistene som ankommer byen med cruiseskip fra Stillehavet.
Byggingen vil være ferdig i 2009.