Prosjektet startet tilbake i 2001: I 1999 ble kontrollen over Panamakanalen overført fra USA til de panamanske myndighetene, og samtidig oppstod spørsmålet om ny bruk av de tilstøtende områdene. En av seksjonene - tidligere okkupert av den amerikanske flybasen - ble tildelt et museum. Byggingen begynte i 2006, men det var først i begynnelsen av oktober at Biomuseo åpnet for publikum - selv om det ennå ikke er fullt: flere haller og et akvarium vil ikke være klare før vinteren 2016.
Med sitt fargerike aluminiumstak skal museet minne om den pulserende naturen i Panama, metalltakene til lokale hytter og de historiske strukturene til kanalinfrastrukturen. Bygningen ligger på en smal halvøy som stikker ut i bukten, og er synlig på lang avstand, og i seg selv kan den tilby besøkende panoramautsikt over byen og Stillehavets "munning" av Panamakanalen.
Varigheten av museets bygging, kalt tilnavnet lokalbefolkningen "museet som aldri vil bli ferdig", forklares blant annet av de lave kvalifikasjonene til lokale byggherrer. Den grove betongen på gulv og vegger måtte helles på nytt mange ganger, og taket med 6 mm toleranser ga også mange vanskeligheter.
Men nå er museet ikke bare vellykket bygget, men nesten fullstendig fylt med utstillingen "The Bridge of Life", som ble designet av Bruce Mau. Smithsonian Institution i Washington var ansvarlig for den vitenskapelige siden av prosjektet, og Biomuseo ble det eneste partnermuseet utenfor USA.
Museet er viet til det fantastiske naturmangfoldet i Ismatos of Panama: med et område på 75.000 km2 er det hjem for flere fuglearter, pattedyr, reptiler og planter enn i USA og Canada til sammen. I tillegg forteller utstillingen i detalj om prosessen med isthmusformasjonen, som begynte for 12 millioner år siden og avsluttet for 3 millioner år siden. Dens utseende forandret økosystemer og klima i planetarisk målestokk: i stedet for et enkelt hav oppsto et helt annet Atlanterhav og Stillehavet, Gulfstrømmen "startet" fra det fremvoksende Karibiske hav, og Nord- og Sør-Amerika forente seg for første gang på 70 millioner år. En aktiv migrasjon av dyr begynte langs ødemarken, og relativt nylig, for 15 000 år siden, passerte de første menneskene denne ruten fra nord til sør.
Biomuseo, som koster $ 95 millioner (ikke medregnet kostnadene for ennå ikke ferdige utstillingslokaler), er primært designet for skolebarn (det er planlagt å bringe 40 000 studenter hvert år dit for gratis utflukter) og for turister, siden cruiseskipterminalen er veldig nærme. Ideelt sett forventer myndighetene "Bilbao-effekten" fra museet. I følge planen deres skulle det bli det samme symbolet på Panama-byen og Panama-landet, som Utsons operahus ble for Sydney og Australia.
