Arkitektene la sin bygning til Mario Botta, bygget i 1995, mens interiøret i de nye og gamle bygningene slås sammen. Endringene som påvirket et av Bottas mest berømte verk forårsaket blandede reaksjoner. For eksempel erstattet Snøhetta-byrået sin trapp i det "ikoniske" sentrale runde tårnet med sitt eget, etter deres mening, og forhindret ikke solstrålene i å komme inn i interiøret gjennom "oculus" som fullfører tårnet - som ble gjort av forgjengeren.
Imidlertid fokuserer verken ledelsen på museet eller arkitektene ved gjenoppbyggingen på copyright-spørsmål, og holder nøkkel moderne bygninger intakte osv. De satte forkant både en økning i området SFMOMA med mer enn to ganger, opp til 42,7 000 m2, og en nærmere forbindelse mellom museet og byen. Nå kan du komme dit fra flere punkter samtidig, og på de nedre nivåene er det romslige lobbyer, hvor du kan komme inn uten å kjøpe billett, selv om det er kunstverk utstilt. Dette trekket, samt gratis tilgang for besøkende i alderen 18 og yngre, er ment å tiltrekke seg publikum som vanligvis ikke er interessert i samtidskunst eller museer generelt, til SFMOMA.
For å forbedre kvaliteten på museumsmiljøet er åpne terrasser med skulpturer og visningsterrasser, den største offentlige grønne veggen i USA (19 000 planter, for det meste typiske for skoger i California), en amfiteatertrapp kledd med lønnetre i lobbyen, som skal bli et populært sted møter og kommunikasjon av byfolk, samt fasaden - 700 paneler laget av glassfiberarmert polymer. Denne gardinveggen er den største for dette materialet i USA, tidligere våget de ikke å bruke slike paneler over 4 etasjer. De hvite pregede fasadene er inspirert av San Francisco-buktens bølger og tåker.
Bygningen hevder å være LEED Gold. De økologiske komponentene inkluderer et LED-belysningssystem (som også gjør det mulig for kuratorer å finjustere lyset), en grønn veggkjøling og rensing av luften i interiøret, høy ytelse i første etasje (individuelt laget tynne stålprofiler i stedet av fabrikkproduserte aluminiumskygger skygger ikke interiøret, mens fritt glass beskytter det mot overoppheting, et spesielt belegg sparer for ultrafiolett stråling, et luftspalte tjener til varmeisolering, etc.), en "gartner" -datamaskin for en grønn vegg sensorer overvåker fuktighet, mengden næringsstoffer, surhet, mens vann er strengt spart i henhold til lovene i tørkeplagget California). Støybeskyttelse er også gitt: takene er dekket med lydabsorberende gips med tillegg av glassflis, trepanelene på trappene er utstyrt med hull og spor som spiller samme rolle.
