Den nye bygningen, som er verdt 79 millioner euro, ligger mellom bystasjonen, den største handlegaten Porschestraße og Volkswagen-anleggskomplekset. I nærheten er det jernbanespor og en skipskanal. Et slikt miljø for fremtidig konstruksjon burde ha skremt arkitekten, men Hadid gikk vellykket inn i museet sitt i det industrielle landskapet.
Bygningen er hevet over bakken på ti tvillingsøyler som ligner omvendte kjegler. De huser en bokbokhandel, et auditorium med 250 sitteplasser, et konferanserom og en inngang til museet.
Dermed er hovedtyngden av bygningen okkupert av et enkelt utstillingsområde; det er ingen klare skiller mellom separate kunnskapsområder, presentert i form av forskjellige installasjoner. De fleste av dem kan lanseres av enhver besøkende; dermed håper arrangørene av museet, gjennom direkte deltagelse av publikum, å gjøre fysikkens lover, de kjemiske egenskapene til stoffer og grunnlaget for biologien mer forståelig for dem.
I dette utstillingsområdet er det ingen foreskrevet ordre for inspeksjon, og takket være særegenheter ved Hadids arkitektur, til og med en person som forestiller seg et arkitektonisk prosjekt og planen mister orientering der etter noen minutter. Taket faller enten ned eller danner romslige saler; gulvet stiger og faller; veggene nærmer seg hverandre og skilles igjen. Men dette presenteres av kundene som en fortjeneste for bygningen: spontaniteten og naturligheten til overgangen fra en utstilling til en annen, fra et tema til et annet, skal bidra til "fordøyeligheten" av den mottatte informasjonen. Zaha Hadid beskriver museets indre som en serie eksploderende partikler.
Spesiell oppmerksomhet ble også gitt til utformingen av nettstedet rundt museet. Det ble opprettet et slags bytorv der, en kobling mellom stasjonen og Volkswagen-anlegget, der, i tillegg til produksjonsanlegg, Autostadt shopping- og underholdningskompleks ligger. Besøkende må passere under museumsbygningen, langs stien som er angitt med en lyseblå linje brolagt på asfalten.
