Utseendet til MUCEM er den viktigste, men ikke den eneste begivenheten i året i Marseille, som fungerer som den europeiske kulturhovedstaden 2013: i tillegg til det dukket Stefano Boeri kultursenter og Norman Foster Pavilion opp i den gamle havnen. Men MUCEM er et mye større foretak, unnfanget i 2000. Dette er kanskje det første museet i verden dedikert til Middelhavet som helhet - en region som er unik i sin rikdom av historie og kultur.
Museet, som ligger på den tidligere moloen J4, i følge arkitektens plan, vender mot skyline og Afrika utenfor, og forener dermed de to bredder av Middelhavet.
Bygningen er et torg med en side på 72 m, der inne er skjult et annet torg, allerede med en side på 52 m, der det er to nivåer av utstillingsgallerier og en konferansesal for 325 personer. I gapet mellom fasaden og "kjernen" i bygningen er det trapper som besøkende klatrer under inspeksjonen. Som et resultat befinner de seg på taket, hvor de vil passere gjennom en 115 m lang fotgjengerbro (77 m spenn) til Fort Saint-Jean, der den andre delen av museets utstilling ligger. Broen, den gjennomsiktige fasaden og taket som dekker glassprismet til bygningen, tre-lignende strukturstøtter - alle er laget av kraftig fiberarmert betong.
Bygningens totale areal var 15 000 m2, hvorav utstillingshallene utgjør 3600 m2 (det vil være en permanent utstilling som byttes ut hvert 3-5 år, og midlertidige utstillinger). Budsjettet for den nye bygningen, inkludert utformingen av utstillingen, beløp seg til 113,4 millioner euro, og totalt ble 191 millioner euro brukt på MUCEM, som også består av Fort Saint-Jean og restaurerings- og arkivsenteret i byen.
