Den fremtredende danske arkitekten døde i søvne om morgenen 29. november i en alder av 90 år. Hans bidrag til arkitekturen på 1900-tallet er mangesidig, men først og fremst er navnet hans knyttet til operahuset i Sydney, en av de første "ikoniske" bygningene i ordets fulle forstand. For Utzon selv ble seieren i konkurransen om utformingen av denne strukturen i 1957 ikke bare veien til verdensberømmelse, men også en alvorlig skuffelse: på grunn av uenigheter med de australske myndighetene måtte han forlate prosjekt i 1966. Han besøkte aldri sin mest berømte kreasjon, selv om han på slutten av 1990-tallet igjen ble bedt om hjelp til gjenoppbyggingen av teaterets interiør, opprinnelig laget ikke i henhold til Utzons plan, men i henhold til planene til lokale arkitekter.
I 2003 ble han tildelt Pritzker-prisen, takket i stor grad til Sydney Opera: juryen bemerket dristigheten i designen og den viktige rollen som et vitnesbyrd om arkitektens og arkitekturens ubegrensede muligheter.
På samme tid, siden 1950, da Utzon grunnla sitt verksted i København, har han realisert mange av sine bygninger i forskjellige land i verden. I sine innovative prosjekter brukte han naturlige former, elementer fra tradisjonell arkitektur, matematikkens lover.