Den nye bygningen ved bredden av Limfjordfjorden, i byen der Jorn Utzon tilbrakte sin barndom og ungdom, ble bygget i henhold til prosjektet til arkitekten selv, utført i samarbeid med sønnen Kim.
Takene på paviljongene rundt gårdsplassen ligner bunnenes bunn. Temaet for skipsbygging er veldig viktig for Utzons arbeid: faren hans var ingeniør som utviklet skipsprosjekter, og tiden som den fremtidige arkitekten brukte på Aalborg-verftet, påvirket i stor grad hans etterfølgende arbeid. Dette er spesielt historien om den første utstillingen i det nye senteret, viet den mest berømte bygningen til mesteren - bygningen til Sydney Opera House.
Sammen med utstillingshaller har komplekset et areal på 2400 kvm. Det er et arkitektonisk bibliotek, en hall for konserter og konferanser, et arkiv med Jorn Utzons tegninger og prosjekter. Senteret vil regelmessig holde klasser i workshopen til fakultetet for arkitektur ved Aalborg universitet, samt ulike seminarer og symposier viet til problemene med arkitektur, design og formgivning.
Blant prosjektene til Utzon, vinneren av Pritzkerprisen 2003, er teatret i Zürich (1964), det parlamentariske komplekset i Kuwait ødelagt under Golfkrigen (1972-1982), Bagswehr-kirken i København (1973-1976).