Etableringen ligger i en av delene av High Line-overgangen. Den mørke galvaniserte stålfasaden avslører en lav bue tegnet av et oransje gardin - dette er inngangen til restauranten. Interiøret domineres av den rå betongen som er typisk for Ando-prosjekter, men i dette tilfellet er den mykgjort av draperier av hvitt glassfiber som dekker taket.
Sushi-baren og hovedrestauranten er gruppert rundt trappene som fører til baren i underetasjen. I midten av trappen er det en installasjon av 17.400 flasker fylt med vann, hver med en LED.
Siden det opprinnelige rommet restauranten ligger i ble brukt som en laste- og losseplattform, tok det mye tid og krefter å gjenoppbygge, noe som til slutt kostet 12 millioner dollar. Morimoto eies av den anerkjente restauratøren Stephen Starr, hvis andre virksomheter er designet av designere som Karim Rashid og David Rockwell.
Restauranten er oppkalt etter kokken Masaharu Morimoto, som er ekstremt populær i USA.
