Arkitekter David Childs og Daniel Libeskind har foredlet "konseptet" til skyskraperen, opprettet i desember 2003, i et og et halvt år. Da den oppdaterte versjonen var nesten klar, kom New York Police Department med et forsinket krav om å gjøre bygningen tryggere og beskyttet den så mye som mulig mot terrorangrep, spesielt fra eksplosjonen av en bombe plantet i en bil.
Som et resultat ble tårnet flyttet bort fra veibanen med 12 meter, og basen ble omgjort til en monolitisk piedestal med en høyde på 20 etasjer (60 m). Totalt vil konstruksjonen stige til 1315 fot (415 m), lik høyden på et av tvillingtårnene, og sammen med takbrystningen vil høyden være 417 m (1.368 fot), som er den samme som andre struktur. Den totale høyden, takket være en enorm spiralantenne, vil nå de symbolske 1771 fot (541 m) - i 1776 fikk USA uavhengighet.
Under prosessen med å bearbeide prosjektet forsvant den energiske, oppover vridd formen til den første utgaven, og spiret, plassert på kanten av tårnet, takket med den løfte hånden til Frihetsgudinnen, flyttet til et stabilt senter. Planen har blitt fra et parallellogram til et kvadrat med en side på 60 m - som i de gamle WTC-skyskrapene. Den lette strukturen på toppen av tårnet med kabler og vindturbiner har forsvunnet helt.
Den kubiske basen av bygningen, hvor bare små vindusåpninger i en høyde av 9 m er gitt, vil huse lobbyen og tekniske gulv. Utsiden av blokken blir opplivet av graverte metallplater.
Landskapsarkitekt Peter Walker, for hvem dette er andre ordre i det nye WTC-komplekset, er kalt til å gjenopplive rommet rundt: han opprettet også et prosjekt med et minnesmerke over ofre for terrorangrep sammen med Michael Arad.
Over vil planens firkant glatt bli til en åttekant, og deretter igjen til en firkant. Generelt har det nye prosjektet mye mer til felles med det gamle World Trade Center, og gitt skyskraperens monolitiske sokkel, overgår det langt forgjengerne når det gjelder alvorlighetsgrad og utilgjengelighet. Responsen på terrorister, som bygningen skal legemliggjøre, har vendt seg fra en utfordring til frihetens verden til en utfordring til et mektig imperium.
